La trama si svolge a Parigi, dove il topolino Remy sogna un giorno di diventare un famoso chef come il suo mito Gusteau, cuoco di un rinomato ristorante della capitale francese vicino al quale Remy si è trasferito con famiglia al seguito.

Il padre e il fratello di Remy si accontentano di mangiare qualsiasi cosa, ma non il protagonista, che invece degusta solo i cibi più raffinati (quando riesce a trovarli) e si allea con il cameriere Linguini per sventare gli immancabili piani diabolici di uno chef rivale di Gusteau.

Ratatouille è un classico action-platform. Possiamo raccogliere oggetti da utilizzare come armi, usare il nostro olfatto per individuare degli hot-spot (segnalati in blu fosforescente) e naturalmente saltare (è anche presente un salto doppio) e arrampicarci su scatole, sporgenze, tavoli e quasi tutto ciò che vediamo all'interno dei livelli.